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核酸提取仪在科研实验中的应用:实验设计与操作全流程


更新时间:2025/05/20 文章来源:新格通达 浏览:39 编辑:boqinglab 搜索看看

核酸作为生命遗传信息的载体,其高效、高质量的提取是众多科研实验开展的基础。博清生物科技(南京)有限公司研发生产的核酸提取仪凭借自动化、标准化的优势,极大提升了核酸提取的效率与准确性。本实验将以土壤微生物核酸提取为例,详细阐述核酸提取仪在科研实验中的应用流程与关键要点。

一、实验目的

利用核酸提取仪从不同土壤样本中高效、高质量地提取微生物核酸,为后续土壤微生物群落结构分析、功能基因研究等提供优质的核酸模板,探究不同土壤环境下微生物群落的差异与变化规律。

二、实验设计

(一) 实验材料

1、样本:采集农田、森林、湿地三种不同生态环境下的土壤样本,每种样本采集3份,共计9份样本。采集时,去除表层杂物,在0-20cm深度处多点取样,混合均匀后取适量分装于无菌离心管中。

2、试剂:土壤微生物核酸提取试剂盒(适配本实验所用核酸提取仪)、无核酸酶水、蛋白酶K、溶菌酶、异丙醇、70%乙醇。

3、仪器:核酸提取仪、高速冷冻离心机、恒温培养箱、涡旋振荡器、微量分光光度计、天平。

(二)样本分组与处理

将9份土壤样本按照采集环境分为3组,即农田组、森林组、湿地组,每组3个生物学重复。在进行核酸提取前,将土壤样本置于4℃冰箱暂存,避免微生物核酸降解。

三、实验操作步骤

(一) 样本预处理

1、称取0.5g土壤样本置于无菌的2ml离心管中,加入500μl含有蛋白酶K和溶菌酶的裂解缓冲液,涡旋振荡1分钟,使土壤颗粒充分分散,裂解缓冲液与土壤中的微生物充分接触。

2、将离心管置于65℃恒温培养箱中水浴30分钟,期间每隔10分钟涡旋振荡10秒,促进微生物细胞裂解,释放核酸。

(二) 核酸提取仪操作

1、根据核酸提取试剂盒说明书和核酸提取仪操作手册,在超净工作台中,将预处理后的土壤样本转移至核酸提取仪配套的深孔板中。

2、在深孔板对应孔位中依次加入磁珠、结合缓冲液、洗涤缓冲液等试剂,确保试剂添加量准确无误。

3、将深孔板放入核酸提取仪中,设置运行程序:振荡混合、结合核酸、洗涤杂质、洗脱核酸等步骤,设定相应的温度、转速和时间参数,启动仪器开始自动提取核酸。

(三) 核酸质量检测

1、核酸提取完成后,从深孔板中吸取5μl提取的核酸溶液,加入495μl无核酸酶水进行稀释。

2、使用微量分光光度计测定稀释后核酸溶液的OD₂₆₀/OD₂₈₀比值和浓度。OD₂₆₀/OD₂₈₀比值在1.8-2.0之间表明核酸纯度较高;同时记录核酸浓度,判断其是否满足后续实验需求。若浓度过低,可通过真空浓缩或乙醇沉淀的方法进行浓缩。

四、实验结果分析

(一)原始数据整理

将微量分光光度计测定得到的9份土壤样本核酸的OD₂₆₀/OD₂₈₀比值和浓度数据进行整理,按照样本分组分别记录。

(二) 数据分析方法

1、采用单因素方差分析(One-way ANOVA)比较农田、森林、湿地三组样本核酸浓度的差异,判断不同土壤环境对微生物核酸提取量的影响是否具有统计学意义(P<0.05表示差异显著)。

2、绘制箱线图展示三组样本核酸OD₂₆₀/OD₂₈₀比值的分布情况,直观呈现不同样本核酸纯度的离散程度和集中趋势。

(三) 结果呈现

1、以表格形式列出每组样本核酸浓度的平均值、标准差,清晰展示不同土壤环境下微生物核酸提取量的差异。

2、结合箱线图和统计分析结果,阐述不同土壤样本核酸纯度的特点,分析可能导致差异的原因,如土壤微生物种类、丰度以及土壤理化性质等因素对核酸提取的影响。

五、实验结论

通过本实验,成功利用博清生物科技(南京)有限公司研发生产的核酸提取仪从不同土壤样本中提取了微生物核酸。实验结果表明,不同土壤环境下提取的微生物核酸在浓度和纯度上存在一定差异,[具体阐述差异情况,如农田土壤样本核酸浓度较高但纯度略低等]。这一结果为后续基于核酸的土壤微生物群落研究奠定了基础,同时也验证了核酸提取仪在土壤微生物核酸提取实验中的高效性和可靠性。后续可进一步结合高通量测序等技术,深入探究不同土壤环境微生物群落的结构与功能,本实验的流程与方法也可为其他涉及核酸提取的科研实验提供参考。


文章来源:http://www.boqinglab.com


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